好處一：化肥養份含量高，肥效快，但持續時間短，養分單一，有機肥正好相反，有機肥與化肥混用可取長補短，滿足作物各個生長期對養分的需要。

好處二：化肥施入土壤后，有些養份被土壤吸收或固定，降低了養份的有效性。而與農農肥混施后，可以減少化肥與土壤的接觸面，減少化肥被土壤固定的幾率，提高養份的有效性。

好處三：一般化肥溶解度大，施用后對土壤造成較高的滲透壓，影響作物對養份和水份的吸收，增加養份流失的機會。如與有機肥搭配混用，能克服這個弊端，促進作物對養份和水份的吸收。

好處四：單一使用化肥，會加劇土壤酸化和鹽漬化，破壞土壤團粒結構，造成板結。如與有機肥搭配混用，能提高土壤的緩沖能力，有效地調節酸堿度，使土壤酸性不至增高。

好處五：因為有機質是微生物生活的能源，化肥是供給微生物生長發育的無機營養。兩者混用能促進微生物的活力，進而促進有機肥的分解。土壤微生物的活動還能產生維生素，生物素，煙堿酸等，增加土壤養份，提高土壤活力，促進作物的生長。